5 ноября 1704 года Петром I был заложен Адмиралтейский Дом, ставший крупнейшим кораблестроительным предприятием России. За три с лишним века со стапелей верфи сошли без малого 3000 кораблей и судов различного класса и назначения.
Инженерами и мастерами адмиралтейских верфей были созданы корабли, ставшие ключевыми в истории флота России: первый отечественный пароход «Елизавета»; броненосная батарея «Не тронь меня»; броненосец береговой обороны «поповка» «Новгород»; первый в мире мореходный миноносец «Взрыв»; корвет «Витязь»; прототип эскадренных броненосцев «Петр Великий»; легендарный крейсер «Аврора»; крупнейший в истории отечественного кораблестроения линейный корабль «Гангут».
К началу Великой Отечественной войны на Адмиралтейских верфях построены 69 подводных лодок серий «М», «Щ», «С» и «К», составивших к началу войны 1/3 боевого состава подводных сил ВМФ СССР, а также 316 торпедных катеров.
В послевоенное время предприятие продолжало строить подводные лодки и боевые надводные корабли, суда гражданского флота различного назначения. В декабре 1959 года на Адмиралтейском заводе был построен первый в мире атомный ледокол «Ленин». В 1969 году была спущена на воду уникальная рыбоперерабатывающая база «Восток» водоизмещением 42 460 тонн, оборудование которой позволяло выпускать до 300 тысяч консервных банок в сутки. 
На Адмиралтейских верфях построены два уникальных корабля командно-измерительного комплекса «Маршал Крылов» и «Маршал Неделин», предназначенные для выполнения научно-практических и боевых задач по обеспечению летно-конструкторских испытаний и для отработки новых образцов ракетно-космической техники.
Кроме того, на предприятии построено более 300 подводных лодок различных проектов (из них 41 атомная), в том числе 45 на экспорт; 70 глубоководных и подводных аппаратов; серия из 8 танкеров проекта 05-55 дедвейтом 47 400 тонн для компании «Совкомфлот»; 2 ледокольных противопожарных буксира проекта 43-70 в рамках программы «Сахалин-2». В 2010 году закончено строительство серии из двух уникальных танкеров усиленного ледового класса проекта Р-70046 дедвейтом 70 000 тонн «Михаил Ульянов» и «Кирилл Лавров». В сентябре 2011 года подписан приемный акт автономного глубоководного аппарата (АГА) «Консул» с глубиной погружения более 6 тысяч метров. В 2012 году передано в эксплуатацию научно-экспедиционное судно «Академик Трёшников», построенное для Российской Антарктической экспедиции. В 2015 году передано заказчику спасательное судно «Игорь Белоусов», предназначенное для спасения экипажей аварийных подводных лодок, со спасательным аппаратом «Бестер-1» и глубоководным водолазным комплексом на борту.
В настоящее время АО «Адмиралтейские верфи» - базовое предприятие судостроительной отрасли, центр неатомного подводного кораблестроения России.
На верфи в строительстве находятся две серии подводных лодок и серия патрульных кораблей ледового класса для Военно-морского флота России. В постройке также серия больших морозильных рыболовных траулеров и ледостойкая самодвижущаяся платформа "Северный полюс". Численность предприятия составляет 7700 человек.